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    北京市農林科學院生物所在谷子miRNA研究方面取得新進展

       2022-05-17 北京市農林科學院429
      近日,北京市農林科學院生物所在Frontiers in Plant Science期刊(影響因子5.753/Q1)發表了題為“The Construction forbid Exploration of a Comprehensive MicroRNA Centered Regulatory Network in Foxtail Millet (Setaria italica L.)”的文章。
     
      在植物生長發育和響應環境應答過程中,MicroRNA(miRNA)及其靶基因發揮重要作用。目前,通過遺傳學等方法對植物中單個miRNA的功能解析越來越多,但是谷子miRNA在基因調控網絡中的作用特點以及與轉錄因子的調控關系仍然未見報道。
     
      該研究針對谷子拔節前期和灌漿前期這2個谷子生長發育關鍵時期,開展谷子miRNA深度測序、降解組和轉錄組等多組學聯合分析,構建了以前饋環路(Feed-Forward Loop)為基準單元的谷子miRNA為中心的調控網絡,其中包括36個轉錄因子家族、266個核心轉錄因子、136個miRNA和2417個下游靶基因以及他們之間的調控關系。
     
      下一步,利用該研究篩選獲得的禾本科特有和谷子特有的核心miRNA,綜合前期谷子重測序相關數據、谷子種質資源表型數據,挖掘和解析谷子千粒重等優異品質性狀的關鍵基因及其調控途徑。
     
      我院生物所職工鄧楊和客座研究生張浩林為本文共同第一作者,我院張杰偉副研究員、魏建華研究員和楊效曾研究員為共同通訊作者,論文的第一通訊單位為北京市農林科學院。該研究得到國家重點研發計劃、我院創新能力建設項目和國家重點實驗室開放基金的資助。
     
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